《神厨小福贵》结局小李子打算接受金厨具，给小福贵冲澡，这使他想起了小福贵刚进宫时，给他冲澡的场景，小李子痛苦不堪，因为他明白，这也许是见小福贵的最后一眼，小福贵临走前，赠给小李子他的工具箱留作纪念。K大人派人到前去宫廷的道上诬陷小福贵，老御医拼命相助，最终和想要诬陷小福贵的厨子们一起死去了。
清末，八国联军侵华进京，慈禧携光绪帝等惊惶西逃。西行道上，因为御膳主厨被小李公公暗害落入山崖下落不明，慈禧只能命宦官小李子在本地选择厨子。他的祖父有一手好厨技，让小李子选成慈禧的专用厨子，可是小福贵在不经意中看到有个人给慈禧的菜品中下了毒。维新变法以后，慈禧对光绪帝非常不满意，有意罢黜却又有一定的顾虑。
因奸臣荣全是一个黑暗料理界的人，也揣测到太后的思绪，收买宦官小李子，打算在菜品里面投毒暗害慈禧，并且用来诬陷光绪，促进慈禧下定决心尽早除掉光绪帝。糊里糊涂之中，小福贵的祖父成为了政治的替罪羊，被确认是投毒凶犯，判处死刑，秋后问斩。身手不凡的小福贵勤学苦练十八般厨技，就在他成为了顶尖御膳主厨时，又卷入了一场政治上面的战争当中。最后，K大人投完毒，小福贵的祖父与太医被害死了，小飞蝶也离开了，小蜜蜂死掉了，小福贵感悟到了民间才有真心实意，他好像听到了小飞蝶的呼唤，跃马而去。